Власти штата Уттар-Прадеш признали, что подачу воздуха в аппараты прервали, однако сказали, что причины смертей были другие.
Большинство жертв были новорожденными или больными энцефалитом.
Все эти смерти случились в течение пяти дней в больнице Баба Рагхав Дас в районе Горакхпур. Тридцать из них произошли в период между четвергом и пятницей, сообщили в больнице.
Местные СМИ сообщили, что в больнице началась паника, родственники детей помогали сотрудникам поддерживать искусственное дыхание вручную.
Представитель муниципалитета Анил Кумар признал, что у поставщика произошла "проблема с оплатой", но сказал, что смерти могли произойти по "естественным" причинам, так как многие из пациентов находились в тяжелом состоянии.
Министр здравоохранения штата Сидхартх Натх Сингх также отрицал, что массовую смерть повлек недостаток кислорода. В больнице регистрируется от 19 до 22 смертей каждый день последние три года, сказал он. Он не уточнил, идет ли речь только о детях или обо всех.
Штат Уттар-Прадеш является одним из самых бедных в Индии. Ежегодно от болезней, в том числе энцефалита, там умирают сотни детей.
"Сегодня вечером или завтра мы получим еще баллоны с кислородом. Мы также рассчитались с поставщиком", - сообщил Кумар.
В заявлении больницы говорится, что "напор кислорода стал низким", что потребовало резервных баллонов. Там не уточнялось, стало ли это причиной чьей-то смерти и почему так много детей погибло всего за пару дней.
Дядя 11-летней девочки, которая умерла в больнице, сказал каналу Эй-би-пи: "Мы не понимали, что происходит. Персонал говорил нам нажимать на маски после каждого счета до трех. И какое-то время мы это делали".
Дело вызвало резонанс в Индии, некоторые называли произошедшее бойней, передает корреспондент Би-би-си в Нью-Дели Санджой Маджумдер.
Оппозиционные лидеры придали событию политический смысл и обвинили в произошедшем партию "Бхаратия джаната" премьер-министра Нарендры Моди , которая находится у власти в штате Уттар-Прадеш.
Представители штата заявили о начавшемся расследовании, аппарат Моди сообщил в Твиттере, что следит за ситуацией.