Pagaidu robežkontroles ne tikai kavē personu brīvu pārvietošanos, bet arī rada ievērojamas ekonomiskās izmaksas. Eiropas Komisija (EK ) aplēsusi, ka pilnvērtīgas robežkontroles atjaunošana tam, lai uzraudzītu cilvēku pārvietošanos Šengenas zonā, radītu tūlītējas tiešās izmaksas līdz 18 miljardiem eiro gadā.
Summa, ko Šengenas sabrukuma gadījumā zaudētu ES, būtu no pieciem līdz 18 miljardiem eiro jeb no 0,05 līdz 0,13 % no ES iekšzemes kopprodukta (IKP), paziņojumā medijiem skaidro EK.
Šīs izmaksas, kā vērtē EK, koncentrētos noteiktos sektoros un reģionos, taču neizbēgami ietekmētu ES ekonomiku kopumā. Piemēram, preču autopārvadājumu izmaksas Polijai, Nīderlandei un Vācijai sadārdzinātos par vairāk nekā 500 miljoniem eiro, bet Spānijas un Čehijas uzņēmumiem izmaksas pieaugtu par vairāk nekā 200 miljoniem eiro, aprēķinājusi EK.